arguments Member List

This is the complete list of members for arguments, including all inherited members.

a	arguments
absolute	arguments
acostaCorrection	arguments
affineJacobianIntensityCorrection	arguments
alignAxes	arguments
alignCentres	arguments
alpha	arguments
alpha	arguments
alphaone	arguments
alphatwo	arguments
argc	arguments
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
arguments()	arguments	inline
argv	arguments
atlasBackgroundValue	arguments
atlasImage	arguments
b	arguments
backGround	arguments
backgroundAtlas	arguments
backgroundData	arguments
backgroundMask	arguments
backgroundValue	arguments
beta	arguments
bgLabel	arguments
bigDelta1	arguments
bigDelta2	arguments
bigN	arguments
bigO	arguments
bins	arguments
blurOutput	arguments
border	arguments
bourgeatCorrection	arguments
brainImageName	arguments
brainMaskImageName	arguments
clampGMPVImageName	arguments
connected	arguments
convergenceThreshold	arguments
csf	arguments
csf	arguments
csf	arguments
csfLabel	arguments
csfMaskImageName	arguments
csfPVImage	arguments
dataBackgroundValue	arguments
dcmDirectoryIn	arguments
dcmDirectoryOut	arguments
debugging	arguments
deepGreyPVImage	arguments
defaultPixelValue	arguments
defaultPixelValue	arguments
deformableTransformName	arguments
deformationFieldName	arguments
dilateValue	arguments
dilations	arguments
dimension	arguments
dirDICOMInput	arguments
direction	arguments
directionSetByUser	arguments
distanceInitialPercentage	arguments
distancePercentageLowerLimit	arguments
distancePercentageMultiplier	arguments
distanceThreshold	arguments
doAcostaCorrection	arguments
doBourgeatCorrection	arguments
doCSFCheck	arguments
doGreyCheck	arguments
doIntensity	arguments
doIsotropicVoxels	arguments
doMaskFromThresholds	arguments
doMaxCheck	arguments
doMean	arguments
doMinCheck	arguments
dontUseGaussSeidel	arguments
doOrthogonal	arguments
doVoxelCheck	arguments
dummyDefault	arguments
dumpTransformed	arguments
dxImage	arguments
dyImage	arguments
dzImage	arguments
edgeAngle	arguments
epsilon	arguments
erodeValue	arguments
et	arguments
ex	arguments
ey	arguments
ez	arguments
factor	arguments
featureAngle	arguments
featureAngle	arguments
featureAngleSpecified	arguments
fileFixedImage	arguments
fileFixedMask	arguments
fileInput	arguments
fileInputDICOM	arguments
fileInputElasticBodySplineMatrix	arguments
fileInputImage	arguments
fileInputMask	arguments
fileInputMITK	arguments
fileInputPointSet	arguments
fileInputSourceImage	arguments
fileInputTagKeys	arguments
fileInputTargetImage	arguments
fileInputThinPlateSplineMatrix	arguments
fileMask	arguments
fileMaskImage	arguments
fileMovingImage	arguments
fileMovingMask	arguments
fileNameFilter	arguments
filenames	arguments
fileOutput	arguments
fileOutputAUC	arguments
fileOutputCSV	arguments
fileOutputDeformationField	arguments
fileOutputElasticBodySplineMatrix	arguments
fileOutputImage	arguments
fileOutputMask	arguments
fileOutputMax	arguments
fileOutputMaxRate	arguments
fileOutputStem	arguments
fileOutputStem	arguments
fileOutputSuffix	arguments
fileOutputSuffix	arguments
fileOutputThinPlateSplineMatrix	arguments
fileOutputTime2Max	arguments
fileOutputTransformFile	arguments
fileOutputWashOut	arguments
fileReferenceImage	arguments
fileSource	arguments
fileSourceImage	arguments
fileSourceLandmarks	arguments
fileTarget	arguments
fileTargetLandmarks	arguments
fileTransform	arguments
finalInterp	arguments
finalInterpolator	arguments
firstArgumentAfterOptions	arguments
fixedImage	arguments
fixedMask	arguments
flg2D	arguments
flg4DScalarImageTo3DVectorImage	arguments
flgAnonymiseDICOMHeader	arguments
flgAnonymiseImageLabel	arguments
flgApplyMaskToImage	arguments
flgClipOutput	arguments
flgCombineMaskAndBoundingBoxViaUnion	arguments
flgDebug	arguments
flgDoNotUseR2LogRThinPlateSpline	arguments
flgDontAnonOtherPatientNames	arguments
flgDontAnonPatientsAddress	arguments
flgDontAnonPatientsBirthDate	arguments
flgDontAnonPatientsBirthName	arguments
flgDontAnonPatientsMothersBirthName	arguments
flgDontAnonPatientsName	arguments
flgDontAnonPatientsTelephoneNumbers	arguments
flgExtrudeInX	arguments
flgExtrudeInY	arguments
flgExtrudeInZ	arguments
flgFatSubtract	arguments
flgFlipHorizontally	arguments
flgFlipVertically	arguments
flgIgnoreView	arguments
flgIncludeBorderRegion	arguments
flgIndicesInMM	arguments
flgInvert	arguments
flgInvertOutputMask	arguments
flgIsotropic	arguments
flgLabel	arguments
flgLargestObject	arguments
flgOverwrite	arguments
flgPectoralis	arguments
flgPreserveImageRange	arguments
flgRemovePectoralMuscle	arguments
flgRender	arguments
flgRescaleIntensitiesToMaxRange	arguments
flgResetOriginToZero	arguments
flgSSD	arguments
flgUseMinimumIntensityFit	arguments
flgUserSetBorderValue	arguments
flgVerbose	arguments
foreGround	arguments
foregroundData	arguments
foregroundValue	arguments
forgroundValue	arguments
fullyConnected	arguments
funcTol	arguments
gaussianImage	arguments
generateErrorScalars	arguments
generateErrorVectors	arguments
globalTransformName	arguments
gmpvmapImage	arguments
gradientVariance	arguments
gradTol	arguments
grey	arguments
grey	arguments
grey	arguments
greyLabel	arguments
greyMaskImageName	arguments
greyPVImage	arguments
halfAffineTransformation	arguments
halfNonLinearTransformation	arguments
high	arguments
higherIntensity	arguments
imagePadSizeX	arguments
imagePadSizeY	arguments
imagePadSizeZ	arguments
imOperation	arguments
inDirectory	arguments
initBoundary	arguments
inLowerPercentile	arguments
inputFile	arguments
inputFilename	arguments
inputFilename1	arguments
inputFilename2	arguments
inputImage	arguments
inputImage1	arguments
inputImage2	arguments
inputImageName	arguments
inputImages	arguments
inputITKTransformFile	arguments
inputMask	arguments
inputPlainTransformFile	arguments
inputPolyDataFile	arguments
inputSurface	arguments
inputTransformFile	arguments
inside	arguments
intensity	arguments
intensityFixedLowerBound	arguments
intensityFixedUpperBound	arguments
intensityMovingLowerBound	arguments
intensityMovingUpperBound	arguments
internal	arguments
internalCSFPVImage	arguments
interpolator	arguments
inUpperPercentile	arguments
invert	arguments
invertAffineTransformation	arguments
invertNonLinearTransformation	arguments
isBin	arguments
isCT	arguments
isIdentity	arguments
isoSurfaceValue	arguments
isoVoxelSize	arguments
isRescaleIntensity	arguments
isStructuredPoints	arguments
isSymMidway	arguments
isTOF	arguments
iterations	arguments
iterFilename	arguments
ix	arguments
iy	arguments
iz	arguments
justMask	arguments
kernelWidth	arguments
labelHeight	arguments
labelImage	arguments
labelPosition	arguments
labelSide	arguments
labelWidth	arguments
lambda	arguments
laplaceIters	arguments
laplaceRatio	arguments
laplacianImage	arguments
learningRate	arguments
levels	arguments
low	arguments
lower	arguments
lowerDensityBound	arguments
lowerIntensity	arguments
m	arguments
majority	arguments
maskImage	arguments
maskImageName	arguments
maskMaximumThreshold	arguments
maskMinimumThreshold	arguments
max	arguments
max	arguments
max	arguments
maxDist	arguments
maxImage	arguments
maximumError	arguments
maximumErrorSpecified	arguments
maxIterationRoundMainLoop	arguments
maxIterations	arguments
maxIterations	arguments
maxLabelRank	arguments
maxLength	arguments
maxPoints	arguments
maxStep	arguments
meanImage	arguments
method	arguments
midlineImage	arguments
min	arguments
min	arguments
min	arguments
minImage	arguments
minimumBlockSize	arguments
minLabelRank	arguments
minNumberOfSlices	arguments
minPC	arguments
minPG	arguments
minPW	arguments
minSize	arguments
minSizeInMM	arguments
minStep	arguments
mod	arguments
mode	arguments
movingImage	arguments
movingImagePadValue	arguments
movingMask	arguments
nIterations	arguments
nObjects	arguments
normalize	arguments
noZero	arguments
numberIterations	arguments
numberOfIterations	arguments
numberOfSubdivisions	arguments
numberOfSymImages	arguments
optimizer	arguments
orderedTraversal	arguments
orientation	arguments
orientation	arguments
origin	arguments
originSetByUser	arguments
outDirectory	arguments
outImageFileFormat	arguments
outLowerLimit	arguments
outPixelType	arguments
outPolyDataFile	arguments
outputCount	arguments
outputDensityImage	arguments
outputDensityValue	arguments
outputDisplacementImage	arguments
outputFatEstimation	arguments
outputFile	arguments
outputFilename	arguments
outputFit	arguments
outputHeader	arguments
outputImage	arguments
outputImageName	arguments
outputImageName	arguments
outputIntensityVsEdgeDist	arguments
outputIQM	arguments
outputITKTransformFile	arguments
outputLabelImage	arguments
outputMask	arguments
outputMatrixTransformFile	arguments
outputMax	arguments
outputMean	arguments
outputMedian	arguments
outputMin	arguments
outputNiftyRegMatrixFile	arguments
outputPectoralMask	arguments
outputPectoralTemplate	arguments
outputPlainTransformFile	arguments
outputPlateRegion	arguments
outputPolyData	arguments
outputPolyDataFile	arguments
outputScalpImage	arguments
outputSD	arguments
outputTemplate	arguments
outputThicknessImage	arguments
outputTransformedMovingImage	arguments
outputUCLTransformFile	arguments
outside	arguments
outUpperLimit	arguments
paddingValue	arguments
parameterChangeTolerance	arguments
paramTol	arguments
pdeIters	arguments
pdeRatio	arguments
perturbTarget	arguments
pointMetric	arguments
poisson	arguments
powellMaxIters	arguments
powellMaxLineIters	arguments
powellStepLength	arguments
powellStepTolerance	arguments
powellValueTolerance	arguments
preserveTopology	arguments
pyramidSubSampling	arguments
radius	arguments
radius	arguments
radius	arguments
randomTransform	arguments
rayThreshold	arguments
regionNumbers	arguments
regionSize	arguments
registrationInterpolator	arguments
registrationStrategy	arguments
relaxationFactor	arguments
relaxFactor	arguments
resampleToIsotropic	arguments
rescaleIntensities	arguments
rescalePVMaps	arguments
resolution	arguments
resolutionReductionFactor	arguments
rotateAboutCog	arguments
rotationWeighting	arguments
rt	arguments
rx	arguments
ry	arguments
rz	arguments
scaleByMillimetres	arguments
scales	arguments
scaleWeighting	arguments
segThreshold	arguments
seriesName	arguments
sigma	arguments
sigma	arguments
sigmaDeformation	arguments
sigmaThickness	arguments
sigmaUpdate	arguments
similarityMeasure	arguments
size	arguments
skewWeighting	arguments
sliceDimension	arguments
smoothEdges	arguments
smoothFeatures	arguments
sourcePolyDataFile	arguments
spacing	arguments
spacingSetByUser	arguments
st	arguments
startingIndex	arguments
startLevel	arguments
step	arguments
steps	arguments
stiffness	arguments
stiffness	arguments
stopLevel	arguments
strAdd2Suffix	arguments
strategy	arguments
strInputOrientation	arguments
strOtherPatientNames	arguments
strOutputOrientation	arguments
strOutputType	arguments
strPatientsAddress	arguments
strPatientsBirthDate	arguments
strPatientsBirthName	arguments
strPatientsMothersBirthName	arguments
strPatientsName	arguments
strPatientsTelephoneNumbers	arguments
subsampling	arguments
subsamplingFactorX	arguments
subsamplingFactorY	arguments
subsamplingFactorZ	arguments
subx	arguments
suby	arguments
subz	arguments
superSamplingFactor	arguments
sx	arguments
sx	arguments
sy	arguments
sy	arguments
symImages	arguments
symmetricMetric	arguments
sz	arguments
sz	arguments
targetPolyDataFile	arguments
targetReductionFactor	arguments
targetReductionFactorSpecified	arguments
tau	arguments
tauImage	arguments
threshold	arguments
tolerance	arguments
tolerance	arguments
transformation	arguments
transformNames	arguments
translationWeighting	arguments
tscalp	arguments
tskull	arguments
upper	arguments
upperDensityBound	arguments
useCogInitialisation	arguments
useForegroundValue	arguments
useLabel	arguments
useLagrangianInitialisation	arguments
useOld	arguments
userSetMaxDistance	arguments
userSetPadValue	arguments
userSpecifiedPyramid	arguments
useSmoothing	arguments
useThicknessPriorImage	arguments
useWeighting	arguments
value	arguments
varianceInitialPercentage	arguments
variancePercentageLowerLimit	arguments
variancePercentageMultiplier	arguments
verbose	arguments
visualise	arguments
voxelMultiplicationFactor	arguments
weightingThreshold	arguments
white	arguments
white	arguments
white	arguments
whiteLabel	arguments
whiteMaskImageName	arguments
whitePVImage	arguments
width	arguments
withGradients	arguments
withNormals	arguments
withScalars	arguments
wmpvmapImage	arguments
writeout	arguments
writePointSet	arguments